实施清单管理，将“两品一械”全部涉企经营许可事项纳入清单管理，清单之外，一律不得设置限制条件。直接取消审批，在全省范围内直接取消１项事项，即药品委托生产审批；在云南自贸试验区试点取消３项事项，即医疗机构使用放射性药品（一、二类）许可、药品零售企业筹建审批、药品批发企业筹建审批。审批改备案，在云南自贸试验区试点将２项涉企经营事项改为备案，即药品互联网信息服务审批、医疗器械互联网服务审批。精简审批材料，优化办事流程，在全省范围内对涉及“两品一械”的“药品生产许可”“化妆品生产许可”“第二类、第三类医疗器械生产许可”等20个事项采取精简审批材料、优化办事流程、压减审批时限等措施优化服务，提高审批效率，减轻企业办事负担。即办事项调整到22项占21%，时限压缩60%。实行并联审批，对同一企业同时变更几个事项（不含中等以上变更事项），实行一次申报一次办理变更，不再分事项分别重复提交申报办理。
为优化行政审批程序，完善监管方式，提高行政效率，积极推行告知承诺制。制定《云南省药品监督管理局行政审批告知承诺管理办法》及告知承诺书文本，在全省范围内对药品互联网服务资格证书、医疗器械互联网服务资格证书、医疗机构购用放射性药品（一、二类）3个审批事项实行告知承诺制。在云南自贸试验区试点对化妆品生产许可延续事项实行告知承诺制。申请企业作出承诺并按要求提交材料后，经形式审查作出许可决定，符合要求的，准予许可并当场作出审批决定，不符合要求的，当场一次性告知需要补充材料。作出审批决定后，依法及时向社会公开审批证书有关信息，便于公众查询，加强社会监督。
截至目前，共网上受理申报件15377件，办结14020件。政务服务“好差评”排名第3位。