康美药业原本的野心在于中药饮片全产业链，其在中药饮片这一环已经形成气候，但市场占有率却并不高。在上游的中药材生产及下游的医院布局等领域，康美药业目前仍处在投资阶段，尚未达到收割期。造假风波的打击对于康美药业全产业链布局会带来哪些影响，目前尚未可知。
但目前来看，康美药业爆雷事件之后，企业生产经营大有举债奋进的姿态。新浪医药在对康美药业市场业务人员求证的时候，对方也表示：“康美爆雷后，除了周围议论纷纷，业务上并没有太大改变和影响，自己也是通过新闻吃企业爆雷的瓜”。
而此前北京鼎臣医药管理咨询中心创始人史立臣在接受采访时也表示：幸亏康美药业主业是中药饮片等，而非化学药，因为化学药的一致性评价定价等关键事由均需最高决策人拍板决定。若“一把手”发生事故，公司两三年就落后了，而康美药业不存在这种顾虑，其供应链和下游供应商体系已经成型，照旧运转即可。而且在中药饮片行业，康美药业具有领先优势，即便马兴田被判3年，可能都不会被竞争对手赶上。
然而，尽管业务上并未受到毁灭性打击，但在资本市场上，造假风波下，投资者的损失却是难以挽回。在未爆出财务造假之前，康美药业股价最高有近28元/股，如今股价仅剩2.95元/股，股价下挫近90%，目前股民们正在多方维权。
在此前公布的处罚结果中，监管部门几乎用了最严厉的措辞来形容康美药业的违法违规行为。然而，康美药业是否会被强制退市，仍然是个迷雾重重的悬念，引发“争论激烈”。大多数股民希望这种“性质恶劣”的公司能够被退市，重罚违法者，提升投资者的信心也有部分股民则认为康美药业没有触及重大违法退市规则，所以不会被退市。